Các tín đồ sùng Phật ở Bhutan dùng cờ như một phần trong nghi thức sùng kính của họ. Cờ được treo trên các dải dây dài, treo quanh nhà và treo trên cách chùa chiền, treo gần sông, hồ và các nơi có núi non được tin là sẽ đem lại hạnh phúc, trường thọ và thịnh vượng cho người sùng bái cũng như cho tất cả dân cư trong vùng.

Cờ cầu nguyện xem như là lễ vật dâng lên Đức Phật và các vị Bồ Tát, các vị thần cai quản sông hồ và núi non. Khi gió  làm các lá cờ tung bay mang theo nội dung cầu nguyện được in trên lá cờ đến nơi gió thổi đến. Cờ cầu nguyện cũng nhắc nhở về thuyết giáo (Những chân lí do Đức Phật dạy bảo) cho các phật tử khi họ phải bận tâm với công việc buôn bán hàng ngày. Năm màu cờ tượng trưng cho 5 thành tố (tạo thành vũ trụ) và cờ cầu nguyện được treo theo thứ tự sau: Màu vàng(đất), Màu xanh(nước), Màu đỏ(lửa), Màu trắng(mây), và Màu xanh dương(bầu trời). Các cờ vải truyền thống được in trên các cờ hiện nay được làm bằng chất liệu bền hơn.